Department for BioMedical Research (DBMR)

Medizinal Software (Floating Licenses)

PDQuest (Bio-Rad)

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Installation / Konfiguration

PDQuest ist eine Software zur Aufnahme, Analyse und Datenbank Archivierung von 1-D (Quantity One) und 2-D Elektrophorese Gelen. PDQuest kann Bilder von Gelen mit Hilfe von verschiedenen Bio-Rad Bildscannern aufnehmen. Ein Bildausschnitt des Gels wird mittels Software Kontrolle ausgewählt und auf dem Bildschirm angezeigt. Hoch aufgelöste Gelbilder können auch im *.tif Format importiert werden. Das Bild kann danach auf verschiedenste Art bearbeitet werden, wie zuschneiden, rotieren, verziehen etc.. Im Modus „Automated Spot Detection and Matching“ können die zu verarbeitenden Bilder oder nur interessierende Spots ausgewählt, Gele aufeinander angeglichen und Matchsets kreiert werden. Der Spot Detection Wizzard hilft durch den Prozess der Spot Detektion und Quantifizierung.Nach der Spot Detektion werden Gele aus derselben Experimentenserie in einem Matchset abgelegt, um Gelvergleiche, statistische Analysen und Datenbank Archivierung durchzuführen. Mithilfe von Histogrammen können Spotvolumen gleicher Spots in einem Matchset einfach und schnell miteinander verglichen werden. Es können auch individuelle Spotsets definiert und annotiert werden, oder Spots aus verschiedenen Experimenten in übergeordneten Matchsets organisiert und verglichen werden.

PDQuest erlaubt das simultane Analysieren von tausenden von Spots aus hunderten von Gelen. Spotdaten können in Form von Datentabellen in andere Applikationen exportiert werden.

Die Software ist kompatibel mit Microsoft Windows; die Version für Mac OS kann leider nicht mit dem Lizenz-Server kommunizieren.